Son zones, que cadascun dels estats membres de la Unió Europea designa dins del seu territori, amb la finalitat de protegir els hàbitats dels ocells que a nivell europeu tenen problemes de conservació.
A Catalunya hi han 6 ZEPAs. Dins de les mateixes s'han d'evitar totes les actuacions que puguin contaminar o deteriorar els hàbitats existents, així com perjudicar a les espècies d'ocells pels quals van ser declarades.

Les ZEPAs formaran part en el futur de la xarxa NATURA 2000, que és la xarxa d'espais naturals protegits d'europa.

La normativa que regula aquest tipus d'espais es troba en la Directiva 79/409/CEE, relativa a la conservació dels ocells silvestres.

Relació de ZEPAs a Catalunya

Nom	Règim de Protecció	Superfície	Principals tipus d'hàbitats	Espècies per a les quals es va declarar
Aigüamolls de l'Empordà	Parc Natural dels Aigüamolls de l'Empordà	867 Ha	Salines, prats salats, llacunes	Martinet menut, trenca
Delta de l'Ebre	Parc Natural del Delta de l'Ebre	7736 Ha	Dunes costaneres, platges de sorra, llacunes, aigües salobres i estancades	Bitó, martinet menut, agró roig, martinet ros, bec d'Alena, perdiu de mar, gavina capblanca, gavina corsa, curroc, xatrac comú, esplugabous, flamenc, xatrac menut, fumarell alablanc, boscarla dels joncs.
Mas de Melons	Reserva Natural Parcial	1140 Ha	Conreus de secà	Ganga, sisó
Aigüestortes i Estany de Sant Maurici	Parc Nacional d'Aigüestortes i Estany de Sant Maurici	10230 Ha	Estanys, llacs, rius, prats alpins, prat humits, prats de dall, boscos caducifolis, boscos subalpins de pins, tarteres.	Trencalòs, perdiu blanca, gall fer, picot negre, gralla de bec groc, mussol pirinenc.
Serra del Cadí-Moixeró	Serra del Cadí-Moixeró	41342 Ha	Estanys, prats alpins, boscos caducifolis, boscos subalpins, roques.	Trencalòs, àliga marcenca, àliga daurada, gall fer, picot negre, mussol pirinenc.
Delta del Llobregat	Reserves Naturals del Delta del Llobregat	573,96 ha	Aigüamolls i estanys, dunes costaneres, pinedes litorals, arbredes, conreus, erms.	Esplugabous, xatracs, gavines, martinet menut, corriol camanegre, rascletó, rasclet.